-    CLINOBEHOITE     -    BeOH2

 

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  P2_1 
Lattice parameters (Å):  11.0200  4.7460  8.6460 
Angles (°):  90  98.94  90 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  P2_1 
Lattice parameters (Å):  10.8424  4.4972  8.2937 
Angles (°):  90  100.32  90 

Cell contents: 

Number of atoms:  60 
Number of atom types: 
Chemical composition: 

Atomic positions (theoretical):

Be:  0.3221  0.5705  0.4174 
Be:  0.3246  0.0696  0.2282 
Be:  0.3237  0.3662  0.9171 
Be:  0.6776  0.3685  0.2731 
Be:  0.9133  0.2005  0.4787 
Be:  0.0868  0.2149  0.0215 
O:  0.3764  0.2424  0.4005 
O:  0.3685  0.7416  0.2711 
O:  0.3823  0.7325  0.5847 
O:  0.1760  0.5687  0.4052 
O:  0.3842  0.2113  0.0847 
O:  0.1762  0.0872  0.1818 
O:  0.3709  0.6980  0.9011 
O:  0.1714  0.3298  0.8878 
O:  0.3629  0.1981  0.7669 
O:  0.0034  0.9545  0.4231 
O:  0.0023  0.4697  0.0778 
O:  0.8294  0.3220  0.3057 
H:  0.3719  0.0884  0.4843 
H:  0.6317  0.3498  0.0133 
H:  0.6117  0.8363  0.3117 
H:  0.3909  0.6020  0.1914 
H:  0.1470  0.3927  0.3387 
H:  0.5230  0.2467  0.4057 
H:  0.9675  0.8776  0.3154 
H:  0.1466  0.9066  0.2295 
H:  0.8356  0.1552  0.2282 
H:  0.8342  0.6637  0.1929 
H:  0.9666  0.3977  0.1700 
H:  0.4783  0.1997  0.0963 
Be:  0.6779  0.0705  0.5826 
Be:  0.6754  0.5696  0.7718 
Be:  0.6763  0.8662  0.0829 
Be:  0.3224  0.8685  0.7269 
Be:  0.0867  0.7005  0.5213 
Be:  0.9132  0.7149  0.9785 
O:  0.6236  0.7424  0.5995 
O:  0.6315  0.2416  0.7289 
O:  0.6177  0.2325  0.4153 
O:  0.8240  0.0687  0.5948 
O:  0.6158  0.7113  0.9153 
O:  0.8238  0.5872  0.8182 
O:  0.6291  0.1980  0.0989 
O:  0.8286  0.8298  0.1122 
O:  0.6371  0.6981  0.2331 
O:  0.9966  0.4545  0.5769 
O:  0.9977  0.9697  0.9222 
O:  0.1706  0.8220  0.6943 
H:  0.6281  0.5884  0.5157 
H:  0.3683  0.8498  0.9867 
H:  0.3883  0.3363  0.6883 
H:  0.6091  0.1020  0.8086 
H:  0.8530  0.8927  0.6613 
H:  0.4770  0.7467  0.5943 
H:  0.0325  0.3776  0.6846 
H:  0.8534  0.4066  0.7705 
H:  0.1644  0.6552  0.7718 
H:  0.1658  0.1637  0.8071 
H:  0.0334  0.8977  0.8300 
H:  0.5217  0.6997  0.9037 
Atom type 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
 

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Be: 1.7326 -0.0047 -0.0379 
-0.0245 1.7088 0.1046 
-0.0315 0.0464 1.7151 
Eig. Value: 1.8049 1.7173 1.6343 
Be: 1.7112 0.0525 0.0464 
-0.0150 1.6987 -0.1102 
0.0015 -0.0335 1.7579 
Eig. Value: 1.7219 1.6389 1.8070 
Be: 1.6744 0.1088 0.0756 
0.0948 1.7352 -0.0989 
0.1093 -0.0164 1.7395 
Eig. Value: 1.5395 1.8150 1.7947 
Be: 1.7452 -0.0421 -0.0556 
-0.0707 1.7268 -0.1160 
-0.1189 -0.0345 1.7137 
Eig. Value: 1.7866 1.5805 1.8187 
Be: 1.7817 0.0913 -0.0164 
0.0101 1.6319 0.0485 
-0.0176 0.0917 1.9048 
Eig. Value: 1.7971 1.5994 1.9219 
Be: 1.7833 -0.1288 -0.0227 
-0.0394 1.6192 0.0577 
-0.0372 0.0677 1.9096 
Eig. Value: 1.7968 1.5771 1.9382 
O: -1.4586 0.0634 -0.0551 
0.0924 -1.6455 -0.0446 
-0.0935 -0.0235 -1.4213 
Eig. Value: -1.5073 -1.6739 -1.3441 
O: -1.1530 0.0427 0.1416 
0.0764 -1.6781 0.1883 
0.2151 0.1399 -1.3701 
Eig. Value: -1.0247 -1.7496 -1.4268 
O: -1.6780 -0.0403 0.1083 
0.0652 -1.5570 -0.0825 
0.0881 -0.0145 -1.6327 
Eig. Value: -1.7640 -1.5221 -1.5816 
O: -1.7134 0.1707 0.1812 
0.1163 -1.2748 -0.1375 
0.1355 -0.1618 -1.3496 
Eig. Value: -1.8365 -1.1574 -1.3440 
O: -1.5899 -0.0016 0.0402 
-0.0571 -1.5482 0.0881 
0.0216 0.0151 -1.6383 
Eig. Value: -1.5751 -1.5213 -1.6800 
O: -1.5765 0.1142 -0.2411 
0.1220 -1.2366 0.1211 
-0.1911 0.1478 -1.4749 
Eig. Value: -1.8027 -1.1746 -1.3108 
O: -1.4219 -0.0827 -0.0853 
-0.1069 -1.6690 0.0252 
-0.1001 0.0061 -1.4280 
Eig. Value: -1.3139 -1.7021 -1.5029 
O: -1.6358 -0.1436 0.0919 
-0.1602 -1.4602 0.0593 
0.0272 0.1299 -1.4091 
Eig. Value: -1.7526 -1.3261 -1.4266 
O: -1.1589 -0.0562 0.1852 
-0.1069 -1.6978 -0.1502 
0.2037 -0.1100 -1.3682 
Eig. Value: -1.0150 -1.7433 -1.4666 
O: -1.3654 0.3725 -0.0861 
0.3875 -1.4146 0.0894 
-0.0062 0.1008 -1.2663 
Eig. Value: -1.0052 -1.7903 -1.2508 
O: -1.3929 0.3793 0.0549 
0.3863 -1.4208 0.0576 
-0.0139 0.0271 -1.2596 
Eig. Value: -1.0158 -1.7904 -1.2671 
O: -1.5944 0.0978 -0.1395 
0.1630 -1.4862 0.0893 
-0.0593 0.1429 -1.4769 
Eig. Value: -1.7595 -1.3624 -1.4357 
H: 0.3265 0.0407 -0.0422 
0.0321 0.9137 -0.3052 
-0.0245 -0.2981 0.6471 
Eig. Value: 0.3230 1.1132 0.4511 
H: 0.3370 0.0285 -0.0241 
0.0250 0.9155 -0.3082 
-0.0154 -0.2857 0.6607 
Eig. Value: 0.3356 1.1127 0.4650 
H: 0.4285 -0.0457 -0.0661 
-0.0446 0.7681 0.1836 
-0.0641 0.1745 0.5676 
Eig. Value: 0.3998 0.8845 0.4798 
H: 0.4025 -0.0392 -0.0407 
-0.0474 0.7407 0.1610 
-0.0514 0.1623 0.5377 
Eig. Value: 0.3881 0.8384 0.4544 
H: 0.4405 -0.0520 -0.0255 
-0.0259 0.7052 0.2365 
-0.0141 0.2504 0.6083 
Eig. Value: 0.4394 0.9089 0.4057 
H: 1.5158 -0.0068 0.0492 
0.0351 0.3661 0.0216 
0.0559 0.0246 0.3526 
Eig. Value: 1.5183 0.3818 0.3343 
H: 0.5153 0.0064 0.1541 
0.0047 0.3824 0.0194 
0.0977 -0.0030 0.5388 
Eig. Value: 0.4007 0.3819 0.6538 
H: 0.4693 0.0366 -0.0318 
0.0462 0.6573 -0.1790 
-0.0435 -0.1979 0.5517 
Eig. Value: 0.4606 0.8094 0.4084 
H: 0.4138 -0.0482 -0.0019 
-0.0968 0.9032 0.4125 
-0.0190 0.3122 0.5494 
Eig. Value: 0.4169 1.1357 0.3138 
H: 0.4403 0.0512 -0.0431 
0.0348 0.8589 -0.3763 
-0.0284 -0.2737 0.5187 
Eig. Value: 0.4360 1.0605 0.3213 
H: 0.6140 0.0206 -0.1472 
0.0297 0.3874 -0.0291 
-0.0921 -0.0038 0.4662 
Eig. Value: 0.6838 0.3841 0.3998 
H: 1.4068 -0.0229 0.0338 
0.0167 0.3695 0.0211 
0.0662 0.0233 0.3558 
Eig. Value: 1.4092 0.3852 0.3377 
Be: 1.7326 0.0047 -0.0379 
0.0245 1.7088 -0.1046 
-0.0315 -0.0464 1.7151 
Eig. Value: 1.8049 1.7173 1.6343 
Be: 1.7112 -0.0525 0.0464 
0.0150 1.6987 0.1102 
0.0015 0.0335 1.7579 
Eig. Value: 1.7219 1.6389 1.8070 
Be: 1.6744 -0.1088 0.0756 
-0.0948 1.7352 0.0989 
0.1093 0.0164 1.7395 
Eig. Value: 1.5395 1.8150 1.7947 
Be: 1.7452 0.0421 -0.0556 
0.0707 1.7268 0.1160 
-0.1189 0.0345 1.7137 
Eig. Value: 1.7866 1.5805 1.8187 
Be: 1.7817 -0.0913 -0.0164 
-0.0101 1.6319 -0.0485 
-0.0176 -0.0917 1.9048 
Eig. Value: 1.7971 1.5994 1.9219 
Be: 1.7833 0.1288 -0.0227 
0.0394 1.6192 -0.0577 
-0.0372 -0.0677 1.9096 
Eig. Value: 1.7968 1.5771 1.9382 
O: -1.4586 -0.0634 -0.0551 
-0.0924 -1.6455 0.0446 
-0.0935 0.0235 -1.4213 
Eig. Value: -1.5073 -1.6739 -1.3441 
O: -1.1530 -0.0427 0.1416 
-0.0764 -1.6781 -0.1883 
0.2151 -0.1399 -1.3701 
Eig. Value: -1.0247 -1.7496 -1.4268 
O: -1.6780 0.0403 0.1083 
-0.0652 -1.5570 0.0825 
0.0881 0.0145 -1.6327 
Eig. Value: -1.7640 -1.5221 -1.5816 
O: -1.7134 -0.1707 0.1812 
-0.1163 -1.2748 0.1375 
0.1355 0.1618 -1.3496 
Eig. Value: -1.8365 -1.1574 -1.3440 
O: -1.5899 0.0016 0.0402 
0.0571 -1.5482 -0.0881 
0.0216 -0.0151 -1.6383 
Eig. Value: -1.5751 -1.5213 -1.6800 
O: -1.5765 -0.1142 -0.2411 
-0.1220 -1.2366 -0.1211 
-0.1911 -0.1478 -1.4749 
Eig. Value: -1.8027 -1.1746 -1.3108 
O: -1.4219 0.0827 -0.0853 
0.1069 -1.6690 -0.0252 
-0.1001 -0.0061 -1.4280 
Eig. Value: -1.3139 -1.7021 -1.5029 
O: -1.6358 0.1436 0.0919 
0.1602 -1.4602 -0.0593 
0.0272 -0.1299 -1.4091 
Eig. Value: -1.7526 -1.3261 -1.4266 
O: -1.1589 0.0562 0.1852 
0.1069 -1.6978 0.1502 
0.2037 0.1100 -1.3682 
Eig. Value: -1.0150 -1.7433 -1.4666 
O: -1.3654 -0.3725 -0.0861 
-0.3875 -1.4146 -0.0894 
-0.0062 -0.1008 -1.2663 
Eig. Value: -1.0052 -1.7903 -1.2508 
O: -1.3929 -0.3793 0.0549 
-0.3863 -1.4208 -0.0576 
-0.0139 -0.0271 -1.2596 
Eig. Value: -1.0158 -1.7904 -1.2671 
O: -1.5944 -0.0978 -0.1395 
-0.1630 -1.4862 -0.0893 
-0.0593 -0.1429 -1.4769 
Eig. Value: -1.7595 -1.3624 -1.4357 
H: 0.3265 -0.0407 -0.0422 
-0.0321 0.9137 0.3052 
-0.0245 0.2981 0.6471 
Eig. Value: 0.3230 1.1132 0.4511 
H: 0.3370 -0.0285 -0.0241 
-0.0250 0.9155 0.3082 
-0.0154 0.2857 0.6607 
Eig. Value: 0.3356 1.1127 0.4650 
H: 0.4285 0.0457 -0.0661 
0.0446 0.7681 -0.1836 
-0.0641 -0.1745 0.5676 
Eig. Value: 0.3998 0.8845 0.4798 
H: 0.4025 0.0392 -0.0407 
0.0474 0.7407 -0.1610 
-0.0514 -0.1623 0.5377 
Eig. Value: 0.3881 0.8384 0.4544 
H: 0.4405 0.0520 -0.0255 
0.0259 0.7052 -0.2365 
-0.0141 -0.2504 0.6083 
Eig. Value: 0.4394 0.9089 0.4057 
H: 1.5158 0.0068 0.0492 
-0.0351 0.3661 -0.0216 
0.0559 -0.0246 0.3526 
Eig. Value: 1.5183 0.3818 0.3343 
H: 0.5153 -0.0064 0.1541 
-0.0047 0.3824 -0.0194 
0.0977 0.0030 0.5388 
Eig. Value: 0.4007 0.3819 0.6538 
H: 0.4693 -0.0366 -0.0318 
-0.0462 0.6573 0.1790 
-0.0435 0.1979 0.5517 
Eig. Value: 0.4606 0.8094 0.4084 
H: 0.4138 0.0482 -0.0019 
0.0968 0.9032 -0.4125 
-0.0190 -0.3122 0.5494 
Eig. Value: 0.4169 1.1357 0.3138 
H: 0.4403 -0.0512 -0.0431 
-0.0348 0.8589 0.3763 
-0.0284 0.2737 0.5187 
Eig. Value: 0.4360 1.0605 0.3213 
H: 0.6140 -0.0206 -0.1472 
-0.0297 0.3874 0.0291 
-0.0921 0.0038 0.4662 
Eig. Value: 0.6838 0.3841 0.3998 
H: 1.4068 0.0229 0.0338 
-0.0167 0.3695 -0.0211 
0.0662 -0.0233 0.3558 
Eig. Value: 1.4092 0.3852 0.3377 
Atom type 

Dielectric tensors: 

 
Ɛ2.5833 0.0000 0.0000 
0.0000 2.6749 0.0000 
0.0000 0.0000 2.6175 
Eig. Value: 2.5833 2.6749 2.6175 
Refractive index (N): 1.6073 0.0000 0.0000 
0.0000 1.6355 0.0000 
0.0000 0.0000 1.6179 
Eig. Value: 1.6073 1.6355 1.6179 
Ɛ00.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000