-    TOPAZ     -    Al2SiO4F2

 

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  62  Pbnm 
Lattice parameters (Å):  4.6499  8.7968  8.3909 
Angles (°):  90.0  90.0  90.0 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  62  Pbnm 
Lattice parameters (Å):  4.6499  8.7968  8.3909 
Angles (°):  90.0  90.0  90.0 

Cell contents: 

Number of atoms:  36 
Number of atom types: 
Chemical composition: 

Atomic positions (theoretical):

Al:  0.9035  0.1310  0.0824 
Si:  0.3978  0.9405  0.2500 
O:  0.7961  0.5321  0.2500 
O:  0.4569  0.7562  0.2500 
O:  0.7893  0.0106  0.9079 
F:  0.9018  0.7526  0.0572 
Al:  0.4035  0.3690  0.9176 
Si:  0.8978  0.5595  0.7500 
O:  0.2961  0.9679  0.7500 
O:  0.9569  0.7437  0.7500 
O:  0.2893  0.4894  0.0921 
F:  0.4018  0.7474  0.9428 
Al:  0.0965  0.8690  0.5824 
Si:  0.6022  0.0595  0.7500 
O:  0.2039  0.4679  0.7500 
O:  0.5431  0.2438  0.7500 
O:  0.2107  0.9894  0.4079 
F:  0.0982  0.2474  0.5572 
Al:  0.5965  0.6310  0.4176 
Si:  0.1022  0.4405  0.2500 
O:  0.7039  0.0321  0.2500 
O:  0.0431  0.2563  0.2500 
O:  0.7107  0.5106  0.5921 
F:  0.5982  0.2526  0.4428 
Al:  0.0965  0.8690  0.9176 
O:  0.2107  0.9894  0.0921 
F:  0.0982  0.2474  0.9428 
Al:  0.5965  0.6310  0.0824 
O:  0.7107  0.5106  0.9079 
F:  0.5982  0.2526  0.0572 
Al:  0.9035  0.1310  0.4176 
O:  0.7893  0.0106  0.5921 
F:  0.9018  0.7526  0.4428 
Al:  0.4035  0.3690  0.5824 
O:  0.2893  0.4894  0.4079 
F:  0.4018  0.7474  0.5572 
Atom type 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
 

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Al: 2.9588 0.0597 -0.1041 
-0.0034 3.0305 0.0771 
0.1664 0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
Si: 3.3431 -0.0774 0.0000 
0.0116 3.3238 0.0000 
-0.0000 0.0000 3.1825 
Eig. Value: 3.3678 3.2992 3.1825 
O: -2.1587 0.6472 0.0000 
0.6286 -1.5755 -0.0000 
-0.0000 -0.0000 -1.6868 
Eig. Value: -2.5685 -1.1657 -1.6868 
O: -1.2661 0.3719 0.0000 
0.3697 -2.4512 0.0000 
-0.0000 0.0000 -1.5871 
Eig. Value: -1.1596 -2.5577 -1.5871 
O: -1.7747 0.3042 -0.4563 
0.2940 -1.5243 -0.0444 
-0.4880 -0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 -0.3262 0.1818 
-0.3329 -1.1547 0.1580 
0.1951 0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 -0.0597 0.1041 
0.0034 3.0305 0.0771 
-0.1664 0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
Si: 3.3431 0.0774 0.0000 
-0.0116 3.3238 -0.0000 
-0.0000 -0.0000 3.1825 
Eig. Value: 3.3678 3.2992 3.1825 
O: -2.1587 -0.6472 0.0000 
-0.6286 -1.5755 0.0000 
-0.0000 0.0000 -1.6868 
Eig. Value: -2.5685 -1.1657 -1.6868 
O: -1.2661 -0.3719 0.0000 
-0.3697 -2.4512 -0.0000 
-0.0000 -0.0000 -1.5871 
Eig. Value: -1.1596 -2.5577 -1.5871 
O: -1.7747 -0.3042 0.4563 
-0.2940 -1.5243 -0.0444 
0.4880 -0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 0.3262 -0.1818 
0.3329 -1.1547 0.1580 
-0.1951 0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 0.0597 0.1041 
-0.0034 3.0305 -0.0771 
-0.1664 -0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
Si: 3.3431 -0.0774 0.0000 
0.0116 3.3238 -0.0000 
0.0000 -0.0000 3.1825 
Eig. Value: 3.3678 3.2992 3.1825 
O: -2.1587 0.6472 -0.0000 
0.6286 -1.5755 0.0000 
0.0000 0.0000 -1.6868 
Eig. Value: -2.5685 -1.1657 -1.6868 
O: -1.2661 0.3719 -0.0000 
0.3697 -2.4512 -0.0000 
0.0000 -0.0000 -1.5871 
Eig. Value: -1.1596 -2.5577 -1.5871 
O: -1.7747 0.3042 0.4563 
0.2940 -1.5243 0.0444 
0.4880 0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 -0.3262 -0.1818 
-0.3329 -1.1547 -0.1580 
-0.1951 -0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 -0.0597 -0.1041 
0.0034 3.0305 -0.0771 
0.1664 -0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
Si: 3.3431 0.0774 -0.0000 
-0.0116 3.3238 0.0000 
0.0000 0.0000 3.1825 
Eig. Value: 3.3678 3.2992 3.1825 
O: -2.1587 -0.6472 -0.0000 
-0.6286 -1.5755 -0.0000 
0.0000 -0.0000 -1.6868 
Eig. Value: -2.5685 -1.1657 -1.6868 
O: -1.2661 -0.3719 -0.0000 
-0.3697 -2.4512 0.0000 
0.0000 0.0000 -1.5871 
Eig. Value: -1.1596 -2.5577 -1.5871 
O: -1.7747 -0.3042 -0.4563 
-0.2940 -1.5243 0.0444 
-0.4880 0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 0.3262 0.1818 
0.3329 -1.1547 -0.1580 
0.1951 -0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 0.0597 -0.1041 
-0.0034 3.0305 0.0771 
0.1664 0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
O: -1.7747 0.3042 -0.4563 
0.2940 -1.5243 -0.0444 
-0.4880 -0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 -0.3262 0.1818 
-0.3329 -1.1547 0.1580 
0.1951 0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 -0.0597 0.1041 
0.0034 3.0305 0.0771 
-0.1664 0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
O: -1.7747 -0.3042 0.4563 
-0.2940 -1.5243 -0.0444 
0.4880 -0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 0.3262 -0.1818 
0.3329 -1.1547 0.1580 
-0.1951 0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 0.0597 0.1041 
-0.0034 3.0305 -0.0771 
-0.1664 -0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
O: -1.7747 0.3042 0.4563 
0.2940 -1.5243 0.0444 
0.4880 0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 -0.3262 -0.1818 
-0.3329 -1.1547 -0.1580 
-0.1951 -0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Al: 2.9588 -0.0597 -0.1041 
0.0034 3.0305 -0.0771 
0.1664 -0.0389 3.1136 
Eig. Value: 2.9482 3.0028 3.1519 
O: -1.7747 -0.3042 -0.4563 
-0.2940 -1.5243 0.0444 
-0.4880 0.0229 -2.0520 
Eig. Value: -1.7178 -1.2002 -2.4330 
F: -1.1433 0.3262 0.1818 
0.3329 -1.1547 -0.1580 
0.1951 -0.1590 -1.0159 
Eig. Value: -0.8145 -1.5845 -0.9149 
Atom type 

Dielectric tensors: 

 
Ɛ2.7025 0.0000 0.0000 
0.0000 2.7140 0.0000 
0.0000 0.0000 2.7329 
Eig. Value: 2.7025 2.7140 2.7329 
Refractive index (N): 1.6439 0.0000 0.0000 
0.0000 1.6474 0.0000 
0.0000 0.0000 1.6531 
Eig. Value: 1.6439 1.6474 1.6531 
Ɛ00.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000