-    GIBBSITE     -    Al(OH)3

Theoretical atomic positions and lattice parameters at experimental volum from AMCSD 

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  14  P2_1/c 
Lattice parameters (Å):  8.7420  5.1120  9.8010 
Angles (°):  90.0  94.5  90.0 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  14  P2_1/c 
Lattice parameters (Å):  8.7963  5.0684  9.7977 
Angles (°):  90.0  91.7  90.0 

Cell contents: 

Number of atoms:  56 
Number of atom types: 
Chemical composition: 

Atomic positions (theoretical):

Al:  0.1654  0.5396  0.9964 
Al:  0.3355  0.0329  0.9964 
O:  0.1866  0.2300  0.8881 
O:  0.6766  0.6449  0.9017 
O:  0.5070  0.1261  0.8970 
O:  0.9817  0.6317  0.8964 
O:  0.2943  0.7330  0.8947 
O:  0.8253  0.1383  0.8985 
H:  0.0886  0.1426  0.8758 
H:  0.5839  0.5374  0.9011 
H:  0.5057  0.1100  0.7965 
H:  0.9476  0.8167  0.8904 
H:  0.2924  0.7343  0.7937 
H:  0.8117  0.1538  0.7982 
Al:  0.3346  0.0396  0.5036 
Al:  0.1645  0.5329  0.5036 
O:  0.3134  0.7300  0.6119 
O:  0.8234  0.1449  0.5983 
O:  0.9930  0.6261  0.6030 
O:  0.5183  0.1317  0.6036 
O:  0.2057  0.2330  0.6053 
O:  0.6747  0.6383  0.6015 
H:  0.4114  0.6426  0.6242 
H:  0.9161  0.0374  0.5989 
H:  0.9943  0.6100  0.7035 
H:  0.5524  0.3167  0.6096 
H:  0.2076  0.2343  0.7063 
H:  0.6883  0.6538  0.7018 
Al:  0.8346  0.4604  0.0036 
Al:  0.6645  0.9671  0.0036 
O:  0.8134  0.7700  0.1119 
O:  0.3234  0.3551  0.0983 
O:  0.4930  0.8739  0.1030 
O:  0.0183  0.3683  0.1036 
O:  0.7057  0.2670  0.1053 
O:  0.1747  0.8617  0.1015 
H:  0.9114  0.8574  0.1242 
H:  0.4161  0.4626  0.0989 
H:  0.4943  0.8900  0.2035 
H:  0.0524  0.1833  0.1096 
H:  0.7076  0.2657  0.2063 
H:  0.1883  0.8462  0.2018 
Al:  0.6654  0.9604  0.4964 
Al:  0.8355  0.4671  0.4964 
O:  0.6866  0.2700  0.3881 
O:  0.1766  0.8551  0.4017 
O:  0.0070  0.3739  0.3970 
O:  0.4817  0.8683  0.3964 
O:  0.7943  0.7670  0.3947 
O:  0.3253  0.3617  0.3985 
H:  0.5886  0.3574  0.3758 
H:  0.0839  0.9626  0.4011 
H:  0.0057  0.3900  0.2965 
H:  0.4476  0.6833  0.3904 
H:  0.7924  0.7657  0.2937 
H:  0.3117  0.3462  0.2982 
Atom type 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
   

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Al: 2.8684 0.0148 0.0534 
0.0681 3.0238 -0.0071 
0.0345 -0.0238 2.4830 
Eig. Value: 2.8637 3.0342 2.4773 
Al: 3.0444 0.0073 -0.0301 
-0.0562 2.8775 0.0084 
0.0289 0.0224 2.5363 
Eig. Value: 3.0479 2.8747 2.5356 
O: -1.2441 0.1823 -0.0479 
0.2160 -1.3809 -0.0386 
-0.0121 -0.0792 -1.6198 
Eig. Value: -1.0953 -1.5148 -1.6347 
O: -1.3065 0.1461 -0.1471 
0.0824 -1.6021 -0.1026 
-0.1362 -0.0809 -1.4808 
Eig. Value: -1.1780 -1.6568 -1.5547 
O: -1.6372 -0.0548 0.0699 
0.0111 -1.2755 0.1651 
0.0458 0.1404 -1.6006 
Eig. Value: -1.5861 -1.2150 -1.7121 
O: -1.5623 0.0908 -0.0261 
0.0549 -1.4044 0.1683 
0.0378 0.1400 -1.5308 
Eig. Value: -1.5606 -1.2861 -1.6508 
O: -1.3410 -0.1790 0.1916 
-0.1977 -1.4909 -0.0752 
0.1658 -0.0382 -1.7406 
Eig. Value: -1.1573 -1.6055 -1.8097 
O: -1.4545 -0.0134 0.1738 
-0.0199 -1.6221 -0.1058 
0.1300 -0.0810 -1.5193 
Eig. Value: -1.3143 -1.5803 -1.7013 
H: 0.5488 -0.0140 -0.0303 
-0.0375 0.4020 -0.0203 
-0.0570 -0.0190 0.3985 
Eig. Value: 0.5630 0.4194 0.3668 
H: 0.4895 0.0666 0.0067 
0.0897 0.6695 0.0130 
-0.0130 -0.0075 0.3787 
Eig. Value: 0.4605 0.6987 0.3785 
H: 0.3681 0.0178 -0.0573 
0.0119 0.3452 -0.0348 
-0.0550 -0.0257 1.0687 
Eig. Value: 0.3696 0.3379 1.0745 
H: 0.5129 -0.2414 -0.0005 
-0.2039 0.7470 -0.0025 
-0.0111 0.0196 0.3730 
Eig. Value: 0.3784 0.8817 0.3727 
H: 0.3650 0.0175 -0.1447 
0.0156 0.3615 0.0271 
-0.1183 0.0193 1.2459 
Eig. Value: 0.3323 0.3745 1.2656 
H: 0.3485 -0.0055 -0.0113 
-0.0022 0.3493 -0.0085 
-0.0400 0.0047 1.0079 
Eig. Value: 0.3444 0.3524 1.0089 
Al: 2.8684 -0.0148 0.0534 
-0.0681 3.0238 0.0071 
0.0345 0.0238 2.4830 
Eig. Value: 2.8637 3.0342 2.4773 
Al: 3.0444 -0.0073 -0.0301 
0.0562 2.8775 -0.0084 
0.0289 -0.0224 2.5363 
Eig. Value: 3.0479 2.8747 2.5356 
O: -1.2441 -0.1823 -0.0479 
-0.2160 -1.3809 0.0386 
-0.0121 0.0792 -1.6198 
Eig. Value: -1.0953 -1.5148 -1.6347 
O: -1.3065 -0.1461 -0.1471 
-0.0824 -1.6021 0.1026 
-0.1362 0.0809 -1.4808 
Eig. Value: -1.1780 -1.6568 -1.5547 
O: -1.6372 0.0548 0.0699 
-0.0111 -1.2755 -0.1651 
0.0458 -0.1404 -1.6006 
Eig. Value: -1.5861 -1.2150 -1.7121 
O: -1.5623 -0.0908 -0.0261 
-0.0549 -1.4044 -0.1683 
0.0378 -0.1400 -1.5308 
Eig. Value: -1.5606 -1.2861 -1.6508 
O: -1.3410 0.1790 0.1916 
0.1977 -1.4909 0.0752 
0.1658 0.0382 -1.7406 
Eig. Value: -1.1573 -1.6055 -1.8097 
O: -1.4545 0.0134 0.1738 
0.0199 -1.6221 0.1058 
0.1300 0.0810 -1.5193 
Eig. Value: -1.3143 -1.5803 -1.7013 
H: 0.5488 0.0140 -0.0303 
0.0375 0.4020 0.0203 
-0.0570 0.0190 0.3985 
Eig. Value: 0.5630 0.4194 0.3668 
H: 0.4895 -0.0666 0.0067 
-0.0897 0.6695 -0.0130 
-0.0130 0.0075 0.3787 
Eig. Value: 0.4605 0.6987 0.3785 
H: 0.3681 -0.0178 -0.0573 
-0.0119 0.3452 0.0348 
-0.0550 0.0257 1.0687 
Eig. Value: 0.3696 0.3379 1.0745 
H: 0.5129 0.2414 -0.0005 
0.2039 0.7470 0.0025 
-0.0111 -0.0196 0.3730 
Eig. Value: 0.3784 0.8817 0.3727 
H: 0.3650 -0.0175 -0.1447 
-0.0156 0.3615 -0.0271 
-0.1183 -0.0193 1.2459 
Eig. Value: 0.3323 0.3745 1.2656 
H: 0.3485 0.0055 -0.0113 
0.0022 0.3493 0.0085 
-0.0400 -0.0047 1.0079 
Eig. Value: 0.3444 0.3524 1.0089 
Al: 2.8684 0.0148 0.0534 
0.0681 3.0238 -0.0071 
0.0345 -0.0238 2.4830 
Eig. Value: 2.8637 3.0342 2.4773 
Al: 3.0444 0.0073 -0.0301 
-0.0562 2.8775 0.0084 
0.0289 0.0224 2.5363 
Eig. Value: 3.0479 2.8747 2.5356 
O: -1.2441 0.1823 -0.0479 
0.2160 -1.3809 -0.0386 
-0.0121 -0.0792 -1.6198 
Eig. Value: -1.0953 -1.5148 -1.6347 
O: -1.3065 0.1461 -0.1471 
0.0824 -1.6021 -0.1026 
-0.1362 -0.0809 -1.4808 
Eig. Value: -1.1780 -1.6568 -1.5547 
O: -1.6372 -0.0548 0.0699 
0.0111 -1.2755 0.1651 
0.0458 0.1404 -1.6006 
Eig. Value: -1.5861 -1.2150 -1.7121 
O: -1.5623 0.0908 -0.0261 
0.0549 -1.4044 0.1683 
0.0378 0.1400 -1.5308 
Eig. Value: -1.5606 -1.2861 -1.6508 
O: -1.3410 -0.1790 0.1916 
-0.1977 -1.4909 -0.0752 
0.1658 -0.0382 -1.7406 
Eig. Value: -1.1573 -1.6055 -1.8097 
O: -1.4545 -0.0134 0.1738 
-0.0199 -1.6221 -0.1058 
0.1300 -0.0810 -1.5193 
Eig. Value: -1.3143 -1.5803 -1.7013 
H: 0.5488 -0.0140 -0.0303 
-0.0375 0.4020 -0.0203 
-0.0570 -0.0190 0.3985 
Eig. Value: 0.5630 0.4194 0.3668 
H: 0.4895 0.0666 0.0067 
0.0897 0.6695 0.0130 
-0.0130 -0.0075 0.3787 
Eig. Value: 0.4605 0.6987 0.3785 
H: 0.3681 0.0178 -0.0573 
0.0119 0.3452 -0.0348 
-0.0550 -0.0257 1.0687 
Eig. Value: 0.3696 0.3379 1.0745 
H: 0.5129 -0.2414 -0.0005 
-0.2039 0.7470 -0.0025 
-0.0111 0.0196 0.3730 
Eig. Value: 0.3784 0.8817 0.3727 
H: 0.3650 0.0175 -0.1447 
0.0156 0.3615 0.0271 
-0.1183 0.0193 1.2459 
Eig. Value: 0.3323 0.3745 1.2656 
H: 0.3485 -0.0055 -0.0113 
-0.0022 0.3493 -0.0085 
-0.0400 0.0047 1.0079 
Eig. Value: 0.3444 0.3524 1.0089 
Al: 2.8684 -0.0148 0.0534 
-0.0681 3.0238 0.0071 
0.0345 0.0238 2.4830 
Eig. Value: 2.8637 3.0342 2.4773 
Al: 3.0444 -0.0073 -0.0301 
0.0562 2.8775 -0.0084 
0.0289 -0.0224 2.5363 
Eig. Value: 3.0479 2.8747 2.5356 
O: -1.2441 -0.1823 -0.0479 
-0.2160 -1.3809 0.0386 
-0.0121 0.0792 -1.6198 
Eig. Value: -1.0953 -1.5148 -1.6347 
O: -1.3065 -0.1461 -0.1471 
-0.0824 -1.6021 0.1026 
-0.1362 0.0809 -1.4808 
Eig. Value: -1.1780 -1.6568 -1.5547 
O: -1.6372 0.0548 0.0699 
-0.0111 -1.2755 -0.1651 
0.0458 -0.1404 -1.6006 
Eig. Value: -1.5861 -1.2150 -1.7121 
O: -1.5623 -0.0908 -0.0261 
-0.0549 -1.4044 -0.1683 
0.0378 -0.1400 -1.5308 
Eig. Value: -1.5606 -1.2861 -1.6508 
O: -1.3410 0.1790 0.1916 
0.1977 -1.4909 0.0752 
0.1658 0.0382 -1.7406 
Eig. Value: -1.1573 -1.6055 -1.8097 
O: -1.4545 0.0134 0.1738 
0.0199 -1.6221 0.1058 
0.1300 0.0810 -1.5193 
Eig. Value: -1.3143 -1.5803 -1.7013 
H: 0.5488 0.0140 -0.0303 
0.0375 0.4020 0.0203 
-0.0570 0.0190 0.3985 
Eig. Value: 0.5630 0.4194 0.3668 
H: 0.4895 -0.0666 0.0067 
-0.0897 0.6695 -0.0130 
-0.0130 0.0075 0.3787 
Eig. Value: 0.4605 0.6987 0.3785 
H: 0.3681 -0.0178 -0.0573 
-0.0119 0.3452 0.0348 
-0.0550 0.0257 1.0687 
Eig. Value: 0.3696 0.3379 1.0745 
H: 0.5129 0.2414 -0.0005 
0.2039 0.7470 0.0025 
-0.0111 -0.0196 0.3730 
Eig. Value: 0.3784 0.8817 0.3727 
H: 0.3650 -0.0175 -0.1447 
-0.0156 0.3615 -0.0271 
-0.1183 -0.0193 1.2459 
Eig. Value: 0.3323 0.3745 1.2656 
H: 0.3485 0.0055 -0.0113 
0.0022 0.3493 0.0085 
-0.0400 -0.0047 1.0079 
Eig. Value: 0.3444 0.3524 1.0089 
Atom type 

Dielectric tensors: 

 
Ɛ2.6094 0.0000 0.0000 
0.0000 2.6094 0.0000 
0.0000 0.0000 2.6677 
Eig. Value: 2.6094 2.6094 2.6677 
Refractive index (N): 1.6154 0.0000 0.0000 
0.0000 1.6154 0.0000 
0.0000 0.0000 1.6333 
Eig. Value: 1.6154 1.6154 1.6333 
Ɛ00.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000