-    NaH3O(HSO4)2     -    NaH3O(HSO4)2

The crystal structure is fully relaxed (both unit cell parameters and atomic positions under symmetry constraints) starting from an experimental structure similar to the one reported in ICSD database; code 78762  

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  14  P12_1/c1 
Lattice parameters (Å):  6.9740  13.0860  8.0800 
Angles (°):  90.0  105.90  90.0 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  14  P12_1/c1 
Lattice parameters (Å):  6.7215  12.6846  7.8405 
Angles (°):  90  106.34  90 

Cell contents: 

Number of atoms:  68 
Number of atom types: 
Chemical composition: 

Atomic positions (theoretical):

Na:  0.9021  0.5427  0.2202 
S:  0.3921  0.5141  0.2344 
S:  0.9765  0.1952  0.8818 
O:  0.2371  0.4847  0.0758 
O:  0.4945  0.4200  0.3347 
O:  0.5498  0.5867  0.2100 
O:  0.2732  0.5686  0.3516 
O:  0.8859  0.1486  0.7055 
O:  0.0709  0.1152  0.0087 
O:  0.1229  0.2803  0.8752 
O:  0.7924  0.2453  0.9300 
O:  0.4436  0.2602  0.1300 
H:  0.3618  0.9239  0.9837 
H:  0.8340  0.2888  0.0509 
H:  0.5613  0.8089  0.8030 
H:  0.4707  0.3218  0.2168 
H:  0.3095  0.2713  0.0264 
Na:  0.0979  0.0427  0.2798 
S:  0.6079  0.0141  0.2656 
S:  0.0235  0.6952  0.6182 
O:  0.7629  0.9847  0.4242 
O:  0.5055  0.9200  0.1653 
O:  0.4502  0.0867  0.2900 
O:  0.7268  0.0686  0.1484 
O:  0.1141  0.6486  0.7945 
O:  0.9291  0.6152  0.4913 
O:  0.8771  0.7803  0.6248 
O:  0.2076  0.7453  0.5700 
O:  0.5564  0.7602  0.3700 
H:  0.6382  0.4239  0.5163 
H:  0.1660  0.7888  0.4491 
H:  0.4387  0.3089  0.6970 
H:  0.5293  0.8218  0.2832 
H:  0.6905  0.7713  0.4736 
Na:  0.0979  0.4573  0.7798 
S:  0.6079  0.4859  0.7656 
S:  0.0235  0.8048  0.1182 
O:  0.7629  0.5153  0.9242 
O:  0.5055  0.5800  0.6653 
O:  0.4502  0.4133  0.7900 
O:  0.7268  0.4314  0.6484 
O:  0.1141  0.8514  0.2945 
O:  0.9291  0.8848  0.9913 
O:  0.8771  0.7197  0.1248 
O:  0.2076  0.7547  0.0700 
O:  0.5564  0.7398  0.8700 
H:  0.6382  0.0761  0.0163 
H:  0.1660  0.7112  0.9491 
H:  0.4387  0.1911  0.1970 
H:  0.5293  0.6782  0.7832 
H:  0.6905  0.7287  0.9736 
Na:  0.9021  0.9573  0.7202 
S:  0.3921  0.9859  0.7344 
S:  0.9765  0.3048  0.3818 
O:  0.2371  0.0153  0.5758 
O:  0.4945  0.0800  0.8347 
O:  0.5498  0.9133  0.7100 
O:  0.2732  0.9314  0.8516 
O:  0.8859  0.3514  0.2055 
O:  0.0709  0.3848  0.5087 
O:  0.1229  0.2197  0.3752 
O:  0.7924  0.2547  0.4300 
O:  0.4436  0.2398  0.6300 
H:  0.3618  0.5761  0.4837 
H:  0.8340  0.2112  0.5509 
H:  0.5613  0.6911  0.3030 
H:  0.4707  0.1782  0.7168 
H:  0.3095  0.2287  0.5264 
Atom type 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
   

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Na: 1.1831 0.0108 0.0586 
-0.0132 1.1809 0.0260 
0.0068 -0.0572 1.1411 
Eig. Value: 1.2044 1.1804 1.1204 
S: 3.0787 0.0443 0.1094 
0.2925 3.5891 -0.3171 
-0.0400 -0.1654 3.3330 
Eig. Value: 2.9890 3.7585 3.2533 
S: 3.3986 0.0883 -0.1051 
-0.0826 3.0457 -0.2324 
-0.1114 0.5060 3.4279 
Eig. Value: 3.3293 2.9984 3.5446 
O: -1.0235 -0.1122 -0.3897 
-0.1906 -0.9503 -0.1624 
-0.4645 -0.1664 -1.6596 
Eig. Value: -0.7795 -0.9321 -1.9217 
O: -0.9089 0.3226 -0.3007 
0.3419 -2.0099 0.2658 
-0.3899 0.2539 -1.7340 
Eig. Value: -0.7402 -2.3201 -1.5925 
O: -1.3797 -0.5485 -0.0011 
-0.6309 -1.8162 -0.1317 
0.1487 -0.0242 -0.9164 
Eig. Value: -1.0510 -2.2271 -0.8342 
O: -1.1341 0.2691 0.2691 
0.2554 -0.9427 -0.2407 
0.2775 -0.3587 -1.8879 
Eig. Value: -1.1194 -0.7501 -2.0952 
O: -0.8095 -0.1384 -0.0170 
-0.0605 -1.0608 0.0374 
-0.1566 -0.1595 -2.4500 
Eig. Value: -0.7726 -1.0900 -2.4578 
O: -0.9593 0.1360 -0.0976 
0.1738 -1.3542 0.5238 
-0.1341 0.3678 -1.3413 
Eig. Value: -0.9364 -1.8355 -0.8829 
O: -1.6663 -0.6176 -0.3264 
-0.4964 -1.3224 0.0339 
-0.3193 -0.0705 -1.1950 
Eig. Value: -2.1556 -0.8143 -1.2138 
O: -1.5436 0.4902 0.4138 
0.3906 -1.1419 -0.3888 
0.4461 -0.6837 -1.5805 
Eig. Value: -2.3798 -0.7494 -1.1367 
O: -0.8887 0.1776 -0.4846 
-0.0985 -1.6058 -0.1620 
-0.3511 -0.0425 -1.2127 
Eig. Value: -0.5944 -1.6408 -1.4720 
H: 0.4532 0.0441 0.2142 
0.0339 0.3902 0.0117 
0.4649 -0.0523 1.7957 
Eig. Value: 0.3376 0.4248 1.8767 
H: 0.3310 -0.1632 -0.2970 
-0.0233 0.7578 0.6404 
-0.0503 0.8980 1.8926 
Eig. Value: 0.3109 0.3698 2.3007 
H: 0.3894 -0.2447 0.1426 
0.0273 1.5420 -0.6202 
-0.0091 -0.3771 0.5081 
Eig. Value: 0.3837 1.7549 0.3010 
H: 0.4290 -0.0526 -0.0241 
-0.0308 1.4110 0.7973 
0.0185 0.5694 0.6727 
Eig. Value: 0.4301 1.8195 0.2630 
H: 1.0504 -0.0421 0.8357 
0.0919 0.2875 0.1114 
0.6638 -0.0585 1.2063 
Eig. Value: 0.3745 0.2867 1.8830 
Na: 1.1831 -0.0108 0.0586 
0.0132 1.1809 -0.0260 
0.0068 0.0572 1.1411 
Eig. Value: 1.2044 1.1804 1.1204 
S: 3.0787 -0.0443 0.1094 
-0.2925 3.5891 0.3171 
-0.0400 0.1654 3.3330 
Eig. Value: 2.9890 3.7585 3.2533 
S: 3.3986 -0.0883 -0.1051 
0.0826 3.0457 0.2324 
-0.1114 -0.5060 3.4279 
Eig. Value: 3.3293 2.9984 3.5446 
O: -1.0235 0.1122 -0.3897 
0.1906 -0.9503 0.1624 
-0.4645 0.1664 -1.6596 
Eig. Value: -0.7795 -0.9321 -1.9217 
O: -0.9089 -0.3226 -0.3007 
-0.3419 -2.0099 -0.2658 
-0.3899 -0.2539 -1.7340 
Eig. Value: -0.7402 -2.3201 -1.5925 
O: -1.3797 0.5485 -0.0011 
0.6309 -1.8162 0.1317 
0.1487 0.0242 -0.9164 
Eig. Value: -1.0510 -2.2271 -0.8342 
O: -1.1341 -0.2691 0.2691 
-0.2554 -0.9427 0.2407 
0.2775 0.3587 -1.8879 
Eig. Value: -1.1194 -0.7501 -2.0952 
O: -0.8095 0.1384 -0.0170 
0.0605 -1.0608 -0.0374 
-0.1566 0.1595 -2.4500 
Eig. Value: -0.7726 -1.0900 -2.4578 
O: -0.9593 -0.1360 -0.0976 
-0.1738 -1.3542 -0.5238 
-0.1341 -0.3678 -1.3413 
Eig. Value: -0.9364 -1.8355 -0.8829 
O: -1.6663 0.6176 -0.3264 
0.4964 -1.3224 -0.0339 
-0.3193 0.0705 -1.1950 
Eig. Value: -2.1556 -0.8143 -1.2138 
O: -1.5436 -0.4902 0.4138 
-0.3906 -1.1419 0.3888 
0.4461 0.6837 -1.5805 
Eig. Value: -2.3798 -0.7494 -1.1367 
O: -0.8887 -0.1776 -0.4846 
0.0985 -1.6058 0.1620 
-0.3511 0.0425 -1.2127 
Eig. Value: -0.5944 -1.6408 -1.4720 
H: 0.4532 -0.0441 0.2142 
-0.0339 0.3902 -0.0117 
0.4649 0.0523 1.7957 
Eig. Value: 0.3376 0.4248 1.8767 
H: 0.3310 0.1632 -0.2970 
0.0233 0.7578 -0.6404 
-0.0503 -0.8980 1.8926 
Eig. Value: 0.3109 0.3698 2.3007 
H: 0.3894 0.2447 0.1426 
-0.0273 1.5420 0.6202 
-0.0091 0.3771 0.5081 
Eig. Value: 0.3837 1.7549 0.3010 
H: 0.4290 0.0526 -0.0241 
0.0308 1.4110 -0.7973 
0.0185 -0.5694 0.6727 
Eig. Value: 0.4301 1.8195 0.2630 
H: 1.0504 0.0421 0.8357 
-0.0919 0.2875 -0.1114 
0.6638 0.0585 1.2063 
Eig. Value: 0.3745 0.2867 1.8830 
Na: 1.1831 0.0108 0.0586 
-0.0132 1.1809 0.0260 
0.0068 -0.0572 1.1411 
Eig. Value: 1.2044 1.1804 1.1204 
S: 3.0787 0.0443 0.1094 
0.2925 3.5891 -0.3171 
-0.0400 -0.1654 3.3330 
Eig. Value: 2.9890 3.7585 3.2533 
S: 3.3986 0.0883 -0.1051 
-0.0826 3.0457 -0.2324 
-0.1114 0.5060 3.4279 
Eig. Value: 3.3293 2.9984 3.5446 
O: -1.0235 -0.1122 -0.3897 
-0.1906 -0.9503 -0.1624 
-0.4645 -0.1664 -1.6596 
Eig. Value: -0.7795 -0.9321 -1.9217 
O: -0.9089 0.3226 -0.3007 
0.3419 -2.0099 0.2658 
-0.3899 0.2539 -1.7340 
Eig. Value: -0.7402 -2.3201 -1.5925 
O: -1.3797 -0.5485 -0.0011 
-0.6309 -1.8162 -0.1317 
0.1487 -0.0242 -0.9164 
Eig. Value: -1.0510 -2.2271 -0.8342 
O: -1.1341 0.2691 0.2691 
0.2554 -0.9427 -0.2407 
0.2775 -0.3587 -1.8879 
Eig. Value: -1.1194 -0.7501 -2.0952 
O: -0.8095 -0.1384 -0.0170 
-0.0605 -1.0608 0.0374 
-0.1566 -0.1595 -2.4500 
Eig. Value: -0.7726 -1.0900 -2.4578 
O: -0.9593 0.1360 -0.0976 
0.1738 -1.3542 0.5238 
-0.1341 0.3678 -1.3413 
Eig. Value: -0.9364 -1.8355 -0.8829 
O: -1.6663 -0.6176 -0.3264 
-0.4964 -1.3224 0.0339 
-0.3193 -0.0705 -1.1950 
Eig. Value: -2.1556 -0.8143 -1.2138 
O: -1.5436 0.4902 0.4138 
0.3906 -1.1419 -0.3888 
0.4461 -0.6837 -1.5805 
Eig. Value: -2.3798 -0.7494 -1.1367 
O: -0.8887 0.1776 -0.4846 
-0.0985 -1.6058 -0.1620 
-0.3511 -0.0425 -1.2127 
Eig. Value: -0.5944 -1.6408 -1.4720 
H: 0.4532 0.0441 0.2142 
0.0339 0.3902 0.0117 
0.4649 -0.0523 1.7957 
Eig. Value: 0.3376 0.4248 1.8767 
H: 0.3310 -0.1632 -0.2970 
-0.0233 0.7578 0.6404 
-0.0503 0.8980 1.8926 
Eig. Value: 0.3109 0.3698 2.3007 
H: 0.3894 -0.2447 0.1426 
0.0273 1.5420 -0.6202 
-0.0091 -0.3771 0.5081 
Eig. Value: 0.3837 1.7549 0.3010 
H: 0.4290 -0.0526 -0.0241 
-0.0308 1.4110 0.7973 
0.0185 0.5694 0.6727 
Eig. Value: 0.4301 1.8195 0.2630 
H: 1.0504 -0.0421 0.8357 
0.0919 0.2875 0.1114 
0.6638 -0.0585 1.2063 
Eig. Value: 0.3745 0.2867 1.8830 
Na: 1.1831 -0.0108 0.0586 
0.0132 1.1809 -0.0260 
0.0068 0.0572 1.1411 
Eig. Value: 1.2044 1.1804 1.1204 
S: 3.0787 -0.0443 0.1094 
-0.2925 3.5891 0.3171 
-0.0400 0.1654 3.3330 
Eig. Value: 2.9890 3.7585 3.2533 
S: 3.3986 -0.0883 -0.1051 
0.0826 3.0457 0.2324 
-0.1114 -0.5060 3.4279 
Eig. Value: 3.3293 2.9984 3.5446 
O: -1.0235 0.1122 -0.3897 
0.1906 -0.9503 0.1624 
-0.4645 0.1664 -1.6596 
Eig. Value: -0.7795 -0.9321 -1.9217 
O: -0.9089 -0.3226 -0.3007 
-0.3419 -2.0099 -0.2658 
-0.3899 -0.2539 -1.7340 
Eig. Value: -0.7402 -2.3201 -1.5925 
O: -1.3797 0.5485 -0.0011 
0.6309 -1.8162 0.1317 
0.1487 0.0242 -0.9164 
Eig. Value: -1.0510 -2.2271 -0.8342 
O: -1.1341 -0.2691 0.2691 
-0.2554 -0.9427 0.2407 
0.2775 0.3587 -1.8879 
Eig. Value: -1.1194 -0.7501 -2.0952 
O: -0.8095 0.1384 -0.0170 
0.0605 -1.0608 -0.0374 
-0.1566 0.1595 -2.4500 
Eig. Value: -0.7726 -1.0900 -2.4578 
O: -0.9593 -0.1360 -0.0976 
-0.1738 -1.3542 -0.5238 
-0.1341 -0.3678 -1.3413 
Eig. Value: -0.9364 -1.8355 -0.8829 
O: -1.6663 0.6176 -0.3264 
0.4964 -1.3224 -0.0339 
-0.3193 0.0705 -1.1950 
Eig. Value: -2.1556 -0.8143 -1.2138 
O: -1.5436 -0.4902 0.4138 
-0.3906 -1.1419 0.3888 
0.4461 0.6837 -1.5805 
Eig. Value: -2.3798 -0.7494 -1.1367 
O: -0.8887 -0.1776 -0.4846 
0.0985 -1.6058 0.1620 
-0.3511 0.0425 -1.2127 
Eig. Value: -0.5944 -1.6408 -1.4720 
H: 0.4532 -0.0441 0.2142 
-0.0339 0.3902 -0.0117 
0.4649 0.0523 1.7957 
Eig. Value: 0.3376 0.4248 1.8767 
H: 0.3310 0.1632 -0.2970 
0.0233 0.7578 -0.6404 
-0.0503 -0.8980 1.8926 
Eig. Value: 0.3109 0.3698 2.3007 
H: 0.3894 0.2447 0.1426 
-0.0273 1.5420 0.6202 
-0.0091 0.3771 0.5081 
Eig. Value: 0.3837 1.7549 0.3010 
H: 0.4290 0.0526 -0.0241 
0.0308 1.4110 -0.7973 
0.0185 -0.5694 0.6727 
Eig. Value: 0.4301 1.8195 0.2630 
H: 1.0504 0.0421 0.8357 
-0.0919 0.2875 -0.1114 
0.6638 0.0585 1.2063 
Eig. Value: 0.3745 0.2867 1.8830 
Atom type 

Dielectric tensors: 

 
Ɛ2.3013 0.0000 0.0660 
0.0000 2.4029 0.0000 
0.0660 0.0000 2.5042 
Eig. Value: 2.2817 2.4029 2.5238 
Refractive index (N): 1.5170 0.0000 0.2569 
0.0000 1.5501 0.0000 
0.2569 0.0000 1.5825 
Eig. Value: 1.5105 1.5501 1.5886 
Ɛ00.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000