-    SZAIBELYITE     -    MgBO2OH

 

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  14  P2_1/a 
Lattice parameters (Å):  12.5860  10.4150  3.1340 
Angles (°):  90  95.92  90 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  14  P2_1/a 
Lattice parameters (Å):  12.4178  10.2043  3.0476 
Angles (°):  90  96.19  90 

Cell contents: 

Number of atoms:  48 
Number of atom types: 
Chemical composition: 

Atomic positions (theoretical):

Mg:  0.5038  0.1359  0.2412 
Mg:  0.4116  0.4204  0.7053 
B:  0.1385  0.1689  0.7680 
B:  0.3066  0.0471  0.6258 
O:  0.0756  0.0624  0.7807 
O:  0.1021  0.2945  0.7830 
O:  0.2492  0.1554  0.7386 
O:  0.2474  0.4492  0.6118 
O:  0.4153  0.0431  0.7189 
O:  0.4082  0.2930  0.2027 
H:  0.1914  0.3789  0.7008 
H:  0.3375  0.2529  0.1107 
Mg:  0.9962  0.6359  0.7588 
Mg:  0.0884  0.9204  0.2947 
B:  0.3615  0.6689  0.2320 
B:  0.1934  0.5471  0.3742 
O:  0.4244  0.5624  0.2193 
O:  0.3979  0.7945  0.2170 
O:  0.2508  0.6554  0.2614 
O:  0.2526  0.9492  0.3882 
O:  0.0847  0.5431  0.2811 
O:  0.0918  0.7930  0.7973 
H:  0.3086  0.8789  0.2992 
H:  0.1625  0.7529  0.8893 
Mg:  0.4962  0.8641  0.7588 
Mg:  0.5884  0.5796  0.2947 
B:  0.8615  0.8311  0.2320 
B:  0.6934  0.9529  0.3742 
O:  0.9244  0.9376  0.2193 
O:  0.8979  0.7055  0.2170 
O:  0.7508  0.8446  0.2614 
O:  0.7526  0.5508  0.3882 
O:  0.5847  0.9569  0.2811 
O:  0.5918  0.7070  0.7973 
H:  0.8086  0.6211  0.2992 
H:  0.6625  0.7471  0.8893 
Mg:  0.0038  0.3641  0.2412 
Mg:  0.9116  0.0796  0.7053 
B:  0.6385  0.3311  0.7680 
B:  0.8066  0.4529  0.6258 
O:  0.5756  0.4376  0.7807 
O:  0.6021  0.2055  0.7830 
O:  0.7492  0.3446  0.7386 
O:  0.7474  0.0508  0.6118 
O:  0.9153  0.4569  0.7189 
O:  0.9082  0.2070  0.2027 
H:  0.6914  0.1211  0.7008 
H:  0.8375  0.2471  0.1107 
Atom type 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
 

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Mg: 2.2426 0.0716 0.0089 
0.1604 1.9809 0.0094 
0.0172 -0.0632 2.0230 
Eig. Value: 2.2867 1.9276 2.0323 
Mg: 2.1135 -0.1247 0.0255 
-0.1015 2.0925 0.0026 
0.0325 0.0639 1.9847 
Eig. Value: 2.2166 2.0312 1.9429 
B: 2.6396 0.0091 -0.0985 
-0.3113 2.7497 -0.0011 
-0.1327 -0.0821 0.8804 
Eig. Value: 2.5422 2.8560 0.8715 
B: 2.4854 -0.4551 0.1640 
-0.1582 2.2331 0.5932 
0.2281 0.5490 1.5996 
Eig. Value: 2.4086 2.7282 1.1813 
O: -1.7831 -0.5440 0.0234 
-0.3762 -2.0175 0.0247 
0.0334 0.0921 -1.2468 
Eig. Value: -1.4265 -2.3787 -1.2422 
O: -1.6486 0.1281 0.1127 
0.0382 -2.4072 0.0907 
0.1481 0.1001 -1.1958 
Eig. Value: -1.6794 -2.4217 -1.1506 
O: -2.3382 0.5780 0.0338 
0.5900 -1.6262 -0.2819 
0.1031 -0.2275 -0.9642 
Eig. Value: -2.6862 -1.3788 -0.8635 
O: -1.4950 -0.1538 -0.0268 
-0.2131 -1.9318 0.5424 
-0.0430 0.4790 -1.3065 
Eig. Value: -1.4970 -2.2457 -0.9907 
O: -2.2894 0.0377 -0.1396 
-0.0153 -1.3829 -0.0656 
-0.1915 -0.0037 -1.3656 
Eig. Value: -2.3182 -1.4026 -1.3170 
O: -1.4388 -0.0649 -0.0508 
-0.0876 -1.5311 -0.0605 
-0.0918 -0.0717 -1.4105 
Eig. Value: -1.3519 -1.6166 -1.4120 
H: 0.9658 0.5857 -0.2206 
0.9266 1.2738 -0.2846 
-0.2777 -0.2362 0.4391 
Eig. Value: 0.3239 1.9755 0.3793 
H: 0.5462 0.1960 0.1681 
0.2128 0.5667 0.1652 
0.1743 0.1425 0.5625 
Eig. Value: 0.3481 0.9120 0.4154 
Mg: 2.2426 -0.0716 0.0089 
-0.1604 1.9809 -0.0094 
0.0172 0.0632 2.0230 
Eig. Value: 2.2867 1.9276 2.0323 
Mg: 2.1135 0.1247 0.0255 
0.1015 2.0925 -0.0026 
0.0325 -0.0639 1.9847 
Eig. Value: 2.2166 2.0312 1.9429 
B: 2.6396 -0.0091 -0.0985 
0.3113 2.7497 0.0011 
-0.1327 0.0821 0.8804 
Eig. Value: 2.5422 2.8560 0.8715 
B: 2.4854 0.4551 0.1640 
0.1582 2.2331 -0.5932 
0.2281 -0.5490 1.5996 
Eig. Value: 2.4086 2.7282 1.1813 
O: -1.7831 0.5440 0.0234 
0.3762 -2.0175 -0.0247 
0.0334 -0.0921 -1.2468 
Eig. Value: -1.4265 -2.3787 -1.2422 
O: -1.6486 -0.1281 0.1127 
-0.0382 -2.4072 -0.0907 
0.1481 -0.1001 -1.1958 
Eig. Value: -1.6794 -2.4217 -1.1506 
O: -2.3382 -0.5780 0.0338 
-0.5900 -1.6262 0.2819 
0.1031 0.2275 -0.9642 
Eig. Value: -2.6862 -1.3788 -0.8635 
O: -1.4950 0.1538 -0.0268 
0.2131 -1.9318 -0.5424 
-0.0430 -0.4790 -1.3065 
Eig. Value: -1.4970 -2.2457 -0.9907 
O: -2.2894 -0.0377 -0.1396 
0.0153 -1.3829 0.0656 
-0.1915 0.0037 -1.3656 
Eig. Value: -2.3182 -1.4026 -1.3170 
O: -1.4388 0.0649 -0.0508 
0.0876 -1.5311 0.0605 
-0.0918 0.0717 -1.4105 
Eig. Value: -1.3519 -1.6166 -1.4120 
H: 0.9658 -0.5857 -0.2206 
-0.9266 1.2738 0.2846 
-0.2777 0.2362 0.4391 
Eig. Value: 0.3239 1.9755 0.3793 
H: 0.5462 -0.1960 0.1681 
-0.2128 0.5667 -0.1652 
0.1743 -0.1425 0.5625 
Eig. Value: 0.3481 0.9120 0.4154 
Mg: 2.2426 0.0716 0.0089 
0.1604 1.9809 0.0094 
0.0172 -0.0632 2.0230 
Eig. Value: 2.2867 1.9276 2.0323 
Mg: 2.1135 -0.1247 0.0255 
-0.1015 2.0925 0.0026 
0.0325 0.0639 1.9847 
Eig. Value: 2.2166 2.0312 1.9429 
B: 2.6396 0.0091 -0.0985 
-0.3113 2.7497 -0.0011 
-0.1327 -0.0821 0.8804 
Eig. Value: 2.5422 2.8560 0.8715 
B: 2.4854 -0.4551 0.1640 
-0.1582 2.2331 0.5932 
0.2281 0.5490 1.5996 
Eig. Value: 2.4086 2.7282 1.1813 
O: -1.7831 -0.5440 0.0234 
-0.3762 -2.0175 0.0247 
0.0334 0.0921 -1.2468 
Eig. Value: -1.4265 -2.3787 -1.2422 
O: -1.6486 0.1281 0.1127 
0.0382 -2.4072 0.0907 
0.1481 0.1001 -1.1958 
Eig. Value: -1.6794 -2.4217 -1.1506 
O: -2.3382 0.5780 0.0338 
0.5900 -1.6262 -0.2819 
0.1031 -0.2275 -0.9642 
Eig. Value: -2.6862 -1.3788 -0.8635 
O: -1.4950 -0.1538 -0.0268 
-0.2131 -1.9318 0.5424 
-0.0430 0.4790 -1.3065 
Eig. Value: -1.4970 -2.2457 -0.9907 
O: -2.2894 0.0377 -0.1396 
-0.0153 -1.3829 -0.0656 
-0.1915 -0.0037 -1.3656 
Eig. Value: -2.3182 -1.4026 -1.3170 
O: -1.4388 -0.0649 -0.0508 
-0.0876 -1.5311 -0.0605 
-0.0918 -0.0717 -1.4105 
Eig. Value: -1.3519 -1.6166 -1.4120 
H: 0.9658 0.5857 -0.2206 
0.9266 1.2738 -0.2846 
-0.2777 -0.2362 0.4391 
Eig. Value: 0.3239 1.9755 0.3793 
H: 0.5462 0.1960 0.1681 
0.2128 0.5667 0.1652 
0.1743 0.1425 0.5625 
Eig. Value: 0.3481 0.9120 0.4154 
Mg: 2.2426 -0.0716 0.0089 
-0.1604 1.9809 -0.0094 
0.0172 0.0632 2.0230 
Eig. Value: 2.2867 1.9276 2.0323 
Mg: 2.1135 0.1247 0.0255 
0.1015 2.0925 -0.0026 
0.0325 -0.0639 1.9847 
Eig. Value: 2.2166 2.0312 1.9429 
B: 2.6396 -0.0091 -0.0985 
0.3113 2.7497 0.0011 
-0.1327 0.0821 0.8804 
Eig. Value: 2.5422 2.8560 0.8715 
B: 2.4854 0.4551 0.1640 
0.1582 2.2331 -0.5932 
0.2281 -0.5490 1.5996 
Eig. Value: 2.4086 2.7282 1.1813 
O: -1.7831 0.5440 0.0234 
0.3762 -2.0175 -0.0247 
0.0334 -0.0921 -1.2468 
Eig. Value: -1.4265 -2.3787 -1.2422 
O: -1.6486 -0.1281 0.1127 
-0.0382 -2.4072 -0.0907 
0.1481 -0.1001 -1.1958 
Eig. Value: -1.6794 -2.4217 -1.1506 
O: -2.3382 -0.5780 0.0338 
-0.5900 -1.6262 0.2819 
0.1031 0.2275 -0.9642 
Eig. Value: -2.6862 -1.3788 -0.8635 
O: -1.4950 0.1538 -0.0268 
0.2131 -1.9318 -0.5424 
-0.0430 -0.4790 -1.3065 
Eig. Value: -1.4970 -2.2457 -0.9907 
O: -2.2894 -0.0377 -0.1396 
0.0153 -1.3829 0.0656 
-0.1915 0.0037 -1.3656 
Eig. Value: -2.3182 -1.4026 -1.3170 
O: -1.4388 0.0649 -0.0508 
0.0876 -1.5311 0.0605 
-0.0918 0.0717 -1.4105 
Eig. Value: -1.3519 -1.6166 -1.4120 
H: 0.9658 -0.5857 -0.2206 
-0.9266 1.2738 0.2846 
-0.2777 0.2362 0.4391 
Eig. Value: 0.3239 1.9755 0.3793 
H: 0.5462 -0.1960 0.1681 
-0.2128 0.5667 -0.1652 
0.1743 -0.1425 0.5625 
Eig. Value: 0.3481 0.9120 0.4154 
Atom type 

Dielectric tensors: 

 
Ɛ2.8941 0.0000 0.0119 
0.0000 2.8715 0.0000 
0.0119 0.0000 2.6285 
Eig. Value: 2.8946 2.8715 2.6279 
Refractive index (N): 1.7012 0.0000 0.1093 
0.0000 1.6946 0.0000 
0.1093 0.0000 1.6213 
Eig. Value: 1.7014 1.6946 1.6211 
Ɛ00.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000