-    WEGSCHEIDERITE     -    Na5CO3(HCO3)3

 

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  P-1 
Lattice parameters (Å):  3.4762  10.0393  15.5969 
Angles (°):  107.770  95.589  95.028 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  P-1 
Lattice parameters (Å):  3.2921  9.7992  15.2507 
Angles (°):  107.48  95.25  94.98 

Cell contents: 

Number of atoms:  48 
Number of atom types: 
Chemical composition: 

Atomic positions (theoretical):

Na:  0.7835  0.6720  0.0463 
Na:  0.8081  0.1781  0.0954 
Na:  0.1809  0.7154  0.2762 
Na:  0.4086  0.2126  0.3025 
Na:  0.7699  0.7483  0.4767 
C:  0.4132  0.4748  0.1388 
C:  0.1368  0.4681  0.3770 
C:  0.2405  0.9335  0.1300 
C:  0.7562  0.9956  0.3804 
O:  0.2753  0.5543  0.0956 
O:  0.3686  0.3401  0.1099 
O:  0.6216  0.5414  0.2223 
O:  0.9326  0.3825  0.3024 
O:  0.1823  0.6022  0.3948 
O:  0.3078  0.4079  0.4342 
O:  0.3197  0.8487  0.0561 
O:  0.2989  0.0687  0.1528 
O:  0.0735  0.8739  0.1885 
O:  0.8804  0.0614  0.3254 
O:  0.7422  0.8619  0.3633 
O:  0.6426  0.0751  0.4574 
H:  0.7417  0.4670  0.2537 
H:  0.5000  0.5000  0.5000 
H:  0.9875  0.9547  0.2446 
H:  0.5000  0.0000  0.5000 
Na:  0.2165  0.3280  0.9537 
Na:  0.1919  0.8219  0.9046 
Na:  0.8191  0.2846  0.7238 
Na:  0.5914  0.7874  0.6975 
Na:  0.2301  0.2517  0.5233 
C:  0.5868  0.5252  0.8612 
C:  0.8632  0.5319  0.6230 
C:  0.7595  0.0665  0.8700 
C:  0.2438  0.0044  0.6196 
O:  0.7247  0.4457  0.9044 
O:  0.6314  0.6599  0.8901 
O:  0.3784  0.4586  0.7777 
O:  0.0674  0.6175  0.6976 
O:  0.8177  0.3978  0.6052 
O:  0.6922  0.5921  0.5658 
O:  0.6803  0.1513  0.9439 
O:  0.7011  0.9313  0.8472 
O:  0.9265  0.1261  0.8115 
O:  0.1196  0.9386  0.6746 
O:  0.2578  0.1381  0.6367 
O:  0.3574  0.9249  0.5426 
H:  0.2583  0.5330  0.7463 
H:  0.0125  0.0453  0.7554 
Atom type 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
 

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Na: 0.9856 -0.0738 0.0669 
-0.0176 1.0777 0.0207 
0.0088 0.1107 1.1483 
Eig. Value: 0.9475 1.0761 1.1880 
Na: 0.9918 0.0453 -0.0189 
0.0033 1.2174 -0.0314 
0.0014 -0.0075 1.1399 
Eig. Value: 0.9889 1.2249 1.1353 
Na: 0.9844 0.0003 -0.0529 
-0.0117 1.2190 0.0844 
0.0001 0.0732 1.0043 
Eig. Value: 1.0045 1.2455 0.9576 
Na: 0.9892 0.0380 -0.0107 
-0.0020 1.2710 0.1035 
-0.0075 0.0437 0.9205 
Eig. Value: 0.9902 1.2867 0.9039 
Na: 0.9831 -0.0341 0.0202 
0.0073 1.2689 0.0861 
-0.0034 0.0684 0.9969 
Eig. Value: 0.9916 1.2897 0.9676 
C: 1.0786 -0.3994 0.9797 
-0.4559 2.5688 -0.1435 
0.9161 0.1416 2.4147 
Eig. Value: 0.5163 2.5368 3.0090 
C: 1.1588 -0.2223 1.1094 
-0.2105 2.2783 -0.0374 
1.0800 -0.0712 2.4901 
Eig. Value: 0.5281 2.2655 3.1335 
C: 1.0987 0.3415 -0.9643 
0.2379 2.4153 0.2508 
-1.0211 0.1143 2.5097 
Eig. Value: 0.5248 2.4754 3.0236 
C: 1.1266 0.1191 -1.1366 
0.1108 2.3038 -0.1354 
-1.0442 -0.1636 2.4553 
Eig. Value: 0.5136 2.2611 3.1110 
O: -0.9984 0.4205 -0.3629 
0.3881 -1.6646 0.5443 
-0.3022 0.4153 -1.2750 
Eig. Value: -0.7633 -2.2117 -0.9629 
O: -0.7839 0.0684 -0.1129 
0.0515 -1.8563 -0.3369 
-0.1087 -0.4306 -1.1490 
Eig. Value: -0.7227 -2.0246 -1.0419 
O: -1.0391 0.2959 -0.7155 
0.2030 -1.0457 0.2056 
-0.7882 0.3475 -2.0261 
Eig. Value: -0.6118 -0.9782 -2.5210 
O: -1.1315 0.0865 -0.7215 
0.0649 -1.2038 -0.1031 
-0.7651 0.0431 -1.9727 
Eig. Value: -0.6856 -1.2162 -2.4063 
O: -0.7829 0.0440 -0.1470 
0.0187 -1.8654 -0.2025 
-0.1337 -0.1750 -1.0070 
Eig. Value: -0.7043 -1.9051 -1.0460 
O: -1.0931 0.1522 -0.8356 
0.2679 -1.2062 0.3872 
-0.7882 0.1872 -2.0160 
Eig. Value: -0.6181 -1.1176 -2.5797 
O: -0.9618 0.1271 0.4313 
0.1414 -1.1002 -0.4498 
0.4656 -0.3837 -1.8955 
Eig. Value: -0.7758 -0.9386 -2.2430 
O: -0.7853 -0.1101 0.1132 
-0.0302 -1.9613 -0.2157 
0.1151 -0.2802 -1.0440 
Eig. Value: -0.7212 -2.0253 -1.0441 
O: -1.0398 -0.1693 0.7612 
-0.2432 -1.0653 0.3076 
0.7554 0.1943 -1.8818 
Eig. Value: -0.5874 -0.9945 -2.4051 
O: -1.0505 -0.2134 0.6641 
-0.2553 -1.3691 0.4272 
0.6222 0.3351 -1.8232 
Eig. Value: -0.6861 -1.1726 -2.3842 
O: -0.7868 0.0454 0.1788 
0.0356 -1.8362 -0.2003 
0.1405 -0.1679 -0.9928 
Eig. Value: -0.6972 -1.8795 -1.0391 
O: -1.1582 -0.1888 0.8398 
-0.0810 -1.1341 0.0341 
0.8418 0.2761 -2.0563 
Eig. Value: -0.6512 -1.1087 -2.5886 
H: 0.7555 -0.6411 0.4221 
-0.3906 0.8664 -0.5113 
0.5442 -1.0332 1.0027 
Eig. Value: 0.3915 0.1491 2.0840 
H: 0.7555 0.4332 0.8124 
0.1002 0.2526 0.1659 
0.7102 0.7696 1.8330 
Eig. Value: 0.3635 0.1137 2.3640 
H: 0.6946 -0.3299 -0.6415 
-0.0906 0.2479 0.1251 
-0.5767 0.5818 1.5432 
Eig. Value: 0.3787 0.1472 1.9597 
H: 0.7734 0.7630 -0.5451 
0.4163 0.8948 -0.5845 
-0.6148 -1.2084 1.1950 
Eig. Value: 0.3695 0.1162 2.3774 
Na: 0.9856 -0.0738 0.0669 
-0.0176 1.0777 0.0207 
0.0088 0.1107 1.1483 
Eig. Value: 0.9475 1.0761 1.1880 
Na: 0.9918 0.0453 -0.0189 
0.0033 1.2174 -0.0314 
0.0014 -0.0075 1.1399 
Eig. Value: 0.9889 1.2249 1.1353 
Na: 0.9844 0.0003 -0.0529 
-0.0117 1.2190 0.0844 
0.0001 0.0732 1.0043 
Eig. Value: 1.0045 1.2455 0.9576 
Na: 0.9892 0.0380 -0.0107 
-0.0020 1.2710 0.1035 
-0.0075 0.0437 0.9205 
Eig. Value: 0.9902 1.2867 0.9039 
Na: 0.9831 -0.0341 0.0202 
0.0073 1.2689 0.0861 
-0.0034 0.0684 0.9969 
Eig. Value: 0.9916 1.2897 0.9676 
C: 1.0786 -0.3994 0.9797 
-0.4559 2.5688 -0.1435 
0.9161 0.1416 2.4147 
Eig. Value: 0.5163 2.5368 3.0090 
C: 1.1588 -0.2223 1.1094 
-0.2105 2.2783 -0.0374 
1.0800 -0.0712 2.4901 
Eig. Value: 0.5281 2.2655 3.1335 
C: 1.0987 0.3415 -0.9643 
0.2379 2.4153 0.2508 
-1.0211 0.1143 2.5097 
Eig. Value: 0.5248 2.4754 3.0236 
C: 1.1266 0.1191 -1.1366 
0.1108 2.3038 -0.1354 
-1.0442 -0.1636 2.4553 
Eig. Value: 0.5136 2.2611 3.1110 
O: -0.9984 0.4205 -0.3629 
0.3881 -1.6646 0.5443 
-0.3022 0.4153 -1.2750 
Eig. Value: -0.7633 -2.2117 -0.9629 
O: -0.7839 0.0684 -0.1129 
0.0515 -1.8563 -0.3369 
-0.1087 -0.4306 -1.1490 
Eig. Value: -0.7227 -2.0246 -1.0419 
O: -1.0391 0.2959 -0.7155 
0.2030 -1.0457 0.2056 
-0.7882 0.3475 -2.0261 
Eig. Value: -0.6118 -0.9782 -2.5210 
O: -1.1315 0.0865 -0.7215 
0.0649 -1.2038 -0.1031 
-0.7651 0.0431 -1.9727 
Eig. Value: -0.6856 -1.2162 -2.4063 
O: -0.7829 0.0440 -0.1470 
0.0187 -1.8654 -0.2025 
-0.1337 -0.1750 -1.0070 
Eig. Value: -0.7043 -1.9051 -1.0460 
O: -1.0931 0.1522 -0.8356 
0.2679 -1.2062 0.3872 
-0.7882 0.1872 -2.0160 
Eig. Value: -0.6181 -1.1176 -2.5797 
O: -0.9618 0.1271 0.4313 
0.1414 -1.1002 -0.4498 
0.4656 -0.3837 -1.8955 
Eig. Value: -0.7758 -0.9386 -2.2430 
O: -0.7853 -0.1101 0.1132 
-0.0302 -1.9613 -0.2157 
0.1151 -0.2802 -1.0440 
Eig. Value: -0.7212 -2.0253 -1.0441 
O: -1.0398 -0.1693 0.7612 
-0.2432 -1.0653 0.3076 
0.7554 0.1943 -1.8818 
Eig. Value: -0.5874 -0.9945 -2.4051 
O: -1.0505 -0.2134 0.6641 
-0.2553 -1.3691 0.4272 
0.6222 0.3351 -1.8232 
Eig. Value: -0.6861 -1.1726 -2.3842 
O: -0.7868 0.0454 0.1788 
0.0356 -1.8362 -0.2003 
0.1405 -0.1679 -0.9928 
Eig. Value: -0.6972 -1.8795 -1.0391 
O: -1.1582 -0.1888 0.8398 
-0.0810 -1.1341 0.0341 
0.8418 0.2761 -2.0563 
Eig. Value: -0.6512 -1.1087 -2.5886 
H: 0.7555 -0.6411 0.4221 
-0.3906 0.8664 -0.5113 
0.5442 -1.0332 1.0027 
Eig. Value: 0.3915 0.1491 2.0840 
H: 0.6946 -0.3299 -0.6415 
-0.0906 0.2479 0.1251 
-0.5767 0.5818 1.5432 
Eig. Value: 0.3787 0.1472 1.9597 
Atom type 

Dielectric tensors: 

 
Ɛ2.1529 0.0000 0.0000 
0.0000 2.3529 0.0000 
0.0000 0.0000 2.4673 
Eig. Value: 2.1528 2.3529 2.4673 
Refractive index (N): 1.4673 0.0000 0.0000 
0.0000 1.5339 0.0000 
0.0000 0.0000 1.5707 
Eig. Value: 1.4673 1.5339 1.5708 
Ɛ00.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000