-    NESQUEHONITE     -    MgCO33H2O

 

Crystal Structure 


Because of the translational symmetry all the calculations are performed in the primitive unit cell and not in the conventional unit cell. The following information regarding the structure is given with respect to this primitive unit cell, which sometimes can take an unintuitive shape.

Symmetry (experimental): 

Space group:  56  Pccn 
Lattice parameters (Å):  7.7010  5.3650  12.1260 
Angles (°):  90  92.14  90 

Symmetry (theoretical): 

Space group:  56  Pccn 
Lattice parameters (Å):  7.3582  5.2820  11.4781 
Angles (°):  90  91.56  90 

Cell contents: 

Number of atoms:  56 
Number of atom types:  4 
Chemical composition:  0 

Atomic positions (theoretical):

Mg:  0.2618  0.0774  0.1471 
C:  0.2295  0.1251  0.4162 
O:  0.5375  0.0863  0.1687 
O:  0.9908  0.0673  0.1384 
O:  0.2744  0.3970  0.0503 
O:  0.2349  0.1897  0.3099 
O:  0.2735  0.8098  0.0103 
O:  0.3042  0.3431  0.8279 
H:  0.5988  0.1660  0.1011 
H:  0.5960  0.9096  0.1717 
H:  0.9002  0.1271  0.0781 
H:  0.9323  0.0786  0.2150 
H:  0.1840  0.3387  0.7844 
H:  0.2852  0.3766  0.9138 
Mg:  0.2382  0.5774  0.3529 
C:  0.2705  0.6251  0.0838 
O:  0.9625  0.5863  0.3313 
O:  0.5092  0.5673  0.3616 
O:  0.2256  0.8970  0.4497 
O:  0.2651  0.6897  0.1901 
O:  0.2265  0.3098  0.4897 
O:  0.1958  0.8431  0.6721 
H:  0.9012  0.6660  0.3989 
H:  0.9040  0.4096  0.3283 
H:  0.5998  0.6271  0.4219 
H:  0.5677  0.5786  0.2850 
H:  0.3160  0.8387  0.7156 
H:  0.2148  0.8766  0.5862 
Mg:  0.7382  0.9226  0.8529 
C:  0.7705  0.8749  0.5838 
O:  0.4625  0.9137  0.8313 
O:  0.0092  0.9327  0.8616 
O:  0.7256  0.6030  0.9497 
O:  0.7651  0.8103  0.6901 
O:  0.7265  0.1902  0.9897 
O:  0.6958  0.6569  0.1721 
H:  0.4012  0.8340  0.8989 
H:  0.4040  0.0904  0.8283 
H:  0.0998  0.8729  0.9219 
H:  0.0677  0.9214  0.7850 
H:  0.8160  0.6613  0.2156 
H:  0.7148  0.6234  0.0862 
Mg:  0.7618  0.4226  0.6471 
C:  0.7295  0.3749  0.9162 
O:  0.0375  0.4137  0.6687 
O:  0.4908  0.4327  0.6384 
O:  0.7744  0.1030  0.5503 
O:  0.7349  0.3103  0.8099 
O:  0.7735  0.6902  0.5103 
O:  0.8042  0.1569  0.3279 
H:  0.0988  0.3340  0.6011 
H:  0.0960  0.5904  0.6717 
H:  0.4002  0.3729  0.5781 
H:  0.4323  0.4214  0.7150 
H:  0.6840  0.1613  0.2844 
H:  0.7852  0.1234  0.4138 
Atom type  X  Y  Z 

We have listed here the reduced coordinates of all the atoms in the primitive unit cell.
It is enough to know only the position of the atoms from the assymetrical unit cell and then use the symmetry to build the whole crystal structure.

Visualization of the crystal structure: 

Size:

 Nx:  Ny:  Nz: 
You can define the size of the supercell to be displayed in the jmol panel as integer translations along the three crys­tallo­gra­phic axis.
Please note that the structure is represented using the pri­mi­tive cell, and not the conventional one.
 

Dielectric Properties 


We define:

  • The Born effective charges, also called dynamical charges, are tensors that correspond to the energy derivative with respect to atomic displacements and electric fields or, equivalently, to the change in atomic force due to an electric field: The sum of the Born effective charges of all nuclei in one cell must vanish, element by element, along each of the three directions of the space.
  • The dielectric tensors are the energy derivative with respect to two electric fields. They also relate the induced polarization to the external electric field.

Born effective charges (Z): 

Mg: 2.0403 -0.0120 -0.0492 
-0.0334 2.1934 -0.0319 
-0.0710 0.2276 1.9580 
Eig. Value: 2.0494 2.2380 1.9044 
C: 0.3329 0.1008 -0.1080 
0.0413 3.1623 -0.0808 
-0.1357 -0.0294 3.0040 
Eig. Value: 0.3257 3.1834 2.9900 
O: -1.2993 0.0529 -0.1115 
0.0903 -1.5165 0.1484 
-0.0076 0.1643 -1.3151 
Eig. Value: -1.2798 -1.6273 -1.2238 
O: -1.2484 0.0366 -0.0277 
0.1034 -0.9174 0.0844 
-0.1371 0.0632 -1.4882 
Eig. Value: -1.2287 -0.8976 -1.5276 
O: -0.5779 0.0705 0.0923 
0.0444 -2.2398 -0.4174 
0.0750 -0.3302 -1.5319 
Eig. Value: -0.5702 -2.4047 -1.3747 
O: -0.6922 -0.0224 0.1020 
-0.0173 -1.2206 0.2488 
0.1076 0.2595 -2.4614 
Eig. Value: -0.6860 -1.1706 -2.5176 
O: -0.8949 0.0568 -0.0018 
0.0075 -1.7037 0.7086 
0.0295 0.6879 -1.9355 
Eig. Value: -0.8898 -1.1168 -2.5275 
O: -1.0501 0.1681 -0.0437 
0.2909 -1.2549 -0.0934 
-0.1342 -0.0156 -1.8155 
Eig. Value: -0.8894 -1.4038 -1.8273 
H: 0.5713 0.1493 -0.3429 
0.1856 0.4728 -0.3284 
-0.4437 -0.2823 1.0450 
Eig. Value: 0.3510 0.3399 1.3983 
H: 0.5799 -0.4245 0.0572 
-0.4855 1.3775 -0.0402 
0.0795 -0.0712 0.2898 
Eig. Value: 0.3884 1.5886 0.2702 
H: 0.7442 -0.1603 0.4218 
-0.2179 0.4351 -0.2355 
0.5297 -0.2176 0.8671 
Eig. Value: 0.3232 0.3455 1.3777 
H: 0.5257 -0.0021 -0.3310 
-0.0155 0.3745 0.1123 
-0.3165 0.1263 1.0076 
Eig. Value: 0.4066 0.3159 1.1853 
H: 0.7229 -0.0188 0.4438 
-0.0732 0.4073 -0.1738 
0.4960 -0.1255 0.7867 
Eig. Value: 0.2496 0.4178 1.2495 
H: 0.2455 -0.0187 -0.1012 
-0.0150 0.4298 0.4482 
-0.0716 0.2391 1.5896 
Eig. Value: 0.2398 0.3361 1.6892 
Mg: 2.0403 0.0120 -0.0492 
0.0334 2.1934 0.0319 
-0.0710 -0.2276 1.9580 
Eig. Value: 2.0494 2.2380 1.9044 
C: 0.3329 -0.1008 -0.1080 
-0.0413 3.1623 0.0808 
-0.1357 0.0294 3.0040 
Eig. Value: 0.3257 3.1834 2.9900 
O: -1.2993 -0.0529 -0.1115 
-0.0903 -1.5165 -0.1484 
-0.0076 -0.1643 -1.3151 
Eig. Value: -1.2798 -1.6273 -1.2238 
O: -1.2484 -0.0366 -0.0277 
-0.1034 -0.9174 -0.0844 
-0.1371 -0.0632 -1.4882 
Eig. Value: -1.2287 -0.8976 -1.5276 
O: -0.5779 -0.0705 0.0923 
-0.0444 -2.2398 0.4174 
0.0750 0.3302 -1.5319 
Eig. Value: -0.5702 -2.4047 -1.3747 
O: -0.6922 0.0224 0.1020 
0.0173 -1.2206 -0.2488 
0.1076 -0.2595 -2.4614 
Eig. Value: -0.6860 -1.1706 -2.5176 
O: -0.8949 -0.0568 -0.0018 
-0.0075 -1.7037 -0.7086 
0.0295 -0.6879 -1.9355 
Eig. Value: -0.8898 -1.1168 -2.5275 
O: -1.0501 -0.1681 -0.0437 
-0.2909 -1.2549 0.0934 
-0.1342 0.0156 -1.8155 
Eig. Value: -0.8894 -1.4038 -1.8273 
H: 0.5713 -0.1493 -0.3429 
-0.1856 0.4728 0.3284 
-0.4437 0.2823 1.0450 
Eig. Value: 0.3510 0.3399 1.3983 
H: 0.5799 0.4245 0.0572 
0.4855 1.3775 0.0402 
0.0795 0.0712 0.2898 
Eig. Value: 0.3884 1.5886 0.2702 
H: 0.7442 0.1603 0.4218 
0.2179 0.4351 0.2355 
0.5297 0.2176 0.8671 
Eig. Value: 0.3232 0.3455 1.3777 
H: 0.5257 0.0021 -0.3310 
0.0155 0.3745 -0.1123 
-0.3165 -0.1263 1.0076 
Eig. Value: 0.4066 0.3159 1.1853 
H: 0.7229 0.0188 0.4438 
0.0732 0.4073 0.1738 
0.4960 0.1255 0.7867 
Eig. Value: 0.2496 0.4178 1.2495 
H: 0.2455 0.0187 -0.1012 
0.0150 0.4298 -0.4482 
-0.0716 -0.2391 1.5896 
Eig. Value: 0.2398 0.3361 1.6892 
Mg: 2.0403 -0.0120 -0.0492 
-0.0334 2.1934 -0.0319 
-0.0710 0.2276 1.9580 
Eig. Value: 2.0494 2.2380 1.9044 
C: 0.3329 0.1008 -0.1080 
0.0413 3.1623 -0.0808 
-0.1357 -0.0294 3.0040 
Eig. Value: 0.3257 3.1834 2.9900 
O: -1.2993 0.0529 -0.1115 
0.0903 -1.5165 0.1484 
-0.0076 0.1643 -1.3151 
Eig. Value: -1.2798 -1.6273 -1.2238 
O: -1.2484 0.0366 -0.0277 
0.1034 -0.9174 0.0844 
-0.1371 0.0632 -1.4882 
Eig. Value: -1.2287 -0.8976 -1.5276 
O: -0.5779 0.0705 0.0923 
0.0444 -2.2398 -0.4174 
0.0750 -0.3302 -1.5319 
Eig. Value: -0.5702 -2.4047 -1.3747 
O: -0.6922 -0.0224 0.1020 
-0.0173 -1.2206 0.2488 
0.1076 0.2595 -2.4614 
Eig. Value: -0.6860 -1.1706 -2.5176 
O: -0.8949 0.0568 -0.0018 
0.0075 -1.7037 0.7086 
0.0295 0.6879 -1.9355 
Eig. Value: -0.8898 -1.1168 -2.5275 
O: -1.0501 0.1681 -0.0437 
0.2909 -1.2549 -0.0934 
-0.1342 -0.0156 -1.8155 
Eig. Value: -0.8894 -1.4038 -1.8273 
H: 0.5713 0.1493 -0.3429 
0.1856 0.4728 -0.3284 
-0.4437 -0.2823 1.0450 
Eig. Value: 0.3510 0.3399 1.3983 
H: 0.5799 -0.4245 0.0572 
-0.4855 1.3775 -0.0402 
0.0795 -0.0712 0.2898 
Eig. Value: 0.3884 1.5886 0.2702 
H: 0.7442 -0.1603 0.4218 
-0.2179 0.4351 -0.2355 
0.5297 -0.2176 0.8671 
Eig. Value: 0.3232 0.3455 1.3777 
H: 0.5257 -0.0021 -0.3310 
-0.0155 0.3745 0.1123 
-0.3165 0.1263 1.0076 
Eig. Value: 0.4066 0.3159 1.1853 
H: 0.7229 -0.0188 0.4438 
-0.0732 0.4073 -0.1738 
0.4960 -0.1255 0.7867 
Eig. Value: 0.2496 0.4178 1.2495 
H: 0.2455 -0.0187 -0.1012 
-0.0150 0.4298 0.4482 
-0.0716 0.2391 1.5896 
Eig. Value: 0.2398 0.3361 1.6892 
Mg: 2.0403 0.0120 -0.0492 
0.0334 2.1934 0.0319 
-0.0710 -0.2276 1.9580 
Eig. Value: 2.0494 2.2380 1.9044 
C: 0.3329 -0.1008 -0.1080 
-0.0413 3.1623 0.0808 
-0.1357 0.0294 3.0040 
Eig. Value: 0.3257 3.1834 2.9900 
O: -1.2993 -0.0529 -0.1115 
-0.0903 -1.5165 -0.1484 
-0.0076 -0.1643 -1.3151 
Eig. Value: -1.2798 -1.6273 -1.2238 
O: -1.2484 -0.0366 -0.0277 
-0.1034 -0.9174 -0.0844 
-0.1371 -0.0632 -1.4882 
Eig. Value: -1.2287 -0.8976 -1.5276 
O: -0.5779 -0.0705 0.0923 
-0.0444 -2.2398 0.4174 
0.0750 0.3302 -1.5319 
Eig. Value: -0.5702 -2.4047 -1.3747 
O: -0.6922 0.0224 0.1020 
0.0173 -1.2206 -0.2488 
0.1076 -0.2595 -2.4614 
Eig. Value: -0.6860 -1.1706 -2.5176 
O: -0.8949 -0.0568 -0.0018 
-0.0075 -1.7037 -0.7086 
0.0295 -0.6879 -1.9355 
Eig. Value: -0.8898 -1.1168 -2.5275 
O: -1.0501 -0.1681 -0.0437 
-0.2909 -1.2549 0.0934 
-0.1342 0.0156 -1.8155 
Eig. Value: -0.8894 -1.4038 -1.8273 
H: 0.5713 -0.1493 -0.3429 
-0.1856 0.4728 0.3284 
-0.4437 0.2823 1.0450 
Eig. Value: 0.3510 0.3399 1.3983 
H: 0.5799 0.4245 0.0572 
0.4855 1.3775 0.0402 
0.0795 0.0712 0.2898 
Eig. Value: 0.3884 1.5886 0.2702 
H: 0.7442 0.1603 0.4218 
0.2179 0.4351 0.2355 
0.5297 0.2176 0.8671 
Eig. Value: 0.3232 0.3455 1.3777 
H: 0.5257 0.0021 -0.3310 
0.0155 0.3745 -0.1123 
-0.3165 -0.1263 1.0076 
Eig. Value: 0.4066 0.3159 1.1853 
H: 0.7229 0.0188 0.4438 
0.0732 0.4073 0.1738 
0.4960 0.1255 0.7867 
Eig. Value: 0.2496 0.4178 1.2495 
H: 0.2455 0.0187 -0.1012 
0.0150 0.4298 -0.4482 
-0.0716 -0.2391 1.5896 
Eig. Value: 0.2398 0.3361 1.6892 
Atom type  X  Y  Z 

Dielectric tensors: 

 X Y Z 
Ɛ∞: 2.1763 0.0000 0.0000 
0.0000 2.4770 0.0000 
0.0000 0.0000 2.6391 
Eig. Value: 2.1763 2.4770 2.6391 
Refractive index (N): 1.4752 0.0000 0.0000 
0.0000 1.5739 0.0000 
0.0000 0.0000 1.6245 
Eig. Value: 1.4752 1.5739 1.6245 
Ɛ0: 0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
0.0000 0.0000 0.0000 
Eig. Value: 0.0000 0.0000 0.0000